一、小儿普通外科及儿童肿瘤外科：小儿急腹症、阑尾炎、鳃裂囊肿（瘘）、甲舌囊肿（瘘）、甲状腺肿瘤、梅克尔憩室、脐疝、原发性腹膜炎、肠梗阻、消化道异物、急性出血坏死性小肠结肠炎、人工肛门的重建、胃十二指肠手术、门脉高压症断流手术、各种分流手术、先天性胆总管囊肿、先天性巨结肠等各种消化道畸形、血管瘤、淋巴管瘤、肝母细胞瘤、肾母细胞瘤、神经母细胞瘤、畸胎瘤、肠道肿瘤、腹腔镜巨结肠根治术、阑尾炎、肿瘤活检腹腔镜手术、脾脏的腹腔镜手术等疗效良好，尤其是腹腔镜疝手术，微创美观、深受欢迎。

二、小儿泌尿外科：目前常规开展泌尿系统先天畸形及肾肿瘤等相关手术（如：隐睾、隐匿性阴茎、肾积水、输尿管反流、重复肾输尿管等）手术治疗。其中，尿道下裂手术的在川东北地区排名第一，手术治疗效果达到国内先进水平。腹腔镜下肾积水、输尿管畸形、输尿管膀胱返流、膀胱憩室、前列腺囊、后尿道瓣膜切除、精索静脉曲张等手术，在国内达到了领先水平。

三、小儿心血管及胸外科：在川东北地区率先开展了低年龄段和低体重儿的先天性心脏病（包括：房间隔缺损、卵圆孔未闭，室间隔缺损和动脉导管未闭）、血管瘤/血管畸形的介入手术，我科为华西儿童心血管专科联盟的常务理事单位，中国儿童血管瘤血管畸形联盟的常委单位。目前介入技术处于西南地区的第一梯队，在国内有较高的知名度。

  另开展了先天性食管闭锁、漏斗胸、鸡胸、先天性食管狭窄、胃食管反流性疾病、先天性肺囊肿、食管烧伤瘢痕性狭窄、脓胸纤维板剥脱、食管裂孔疝、膈疝。

四、小儿骨科及矫形外科：先天性髋关节脱位、先天性马蹄内翻足、髋内外翻、膝内外翻、先天性斜颈、多指及并指、肢体不等长、胫骨假关节等。

五、小儿神经外科手术：我科率先在川东北地区开展小儿神经外科。目前主要收治神经系统创伤、各种脑挫伤、硬膜下血肿、硬膜外血肿、凹陷性骨折，神经系统先天性疾病，如脑积水、外部性脑积水、蛛网膜囊肿、脑脊膜膨出与脊髓栓系综合征等、颅内及椎管内肿瘤、难治性癫痫、颅内血管性疾病，以及其他小儿神经系统的疾病，具有丰富的临床诊治经验。尤其在特重型颅脑损伤及昏迷患儿的抢救治疗及后期康复治疗方面有丰富经验，提高了患儿生存质量。

六、新生儿外科：各种新生儿先天性畸形（包括但不限于以下疾病）先天性幽门肥厚狭窄、先天性肠闭锁和肠狭窄、先天性肠旋转不良、新生儿消化道穿孔、胎粪性腹膜炎、新生儿坏死性小肠结肠炎、脐膨出与腹裂、消化道重复畸形、肠套叠、先天性肛门和直肠发育畸形、胆道闭锁、脐疝、卵黄管瘘、脐尿管瘘、尿道瓣膜症等。我科在川东北地区率先开展新生儿外科手术，为生后即有缺陷的儿童带来希望和福音。